Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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