Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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