Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPRL3Q12980 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms