Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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