Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
BPTFQ12830 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
BPTFQ12830 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms