Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERFP50548 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERFP50548 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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