Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRMP28827 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTPRMP28827 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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PTPRMP28827 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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PTPRMP28827 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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PTPRMP28827 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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PTPRMP28827 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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PTPRMP28827 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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