Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRDP23468 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRDP23468 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRDP23468 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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