Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PTPRAP18433 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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PTPRAP18433 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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PTPRAP18433 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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