Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKHD1P08F94 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms