Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms