Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms