Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP53Q70EK8 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP53Q70EK8 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP53Q70EK8 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP53Q70EK8 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP53Q70EK8 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP53Q70EK8 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP53Q70EK8 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP53Q70EK8 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP53Q70EK8 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP53Q70EK8 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP53Q70EK8 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP53Q70EK8 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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