Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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CCDC142Q17RM4 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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CCDC142Q17RM4 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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CCDC142Q17RM4 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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CCDC142Q17RM4 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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CCDC142Q17RM4 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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CCDC142Q17RM4 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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CCDC142Q17RM4 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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CCDC142Q17RM4 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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CCDC142Q17RM4 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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CCDC142Q17RM4 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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