Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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