Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA3Q16787 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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LAMA3Q16787 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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LAMA3Q16787 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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LAMA3Q16787 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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LAMA3Q16787 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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LAMA3Q16787 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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