Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLPPQ16740 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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