Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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