Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms