Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USF2Q15853 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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