Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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