Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms