Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms