Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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