Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEDD9Q14511 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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