Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SCARF1Q14162 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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