Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PDE1CQ14123 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE1CQ14123 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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