Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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