Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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