Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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CDH18Q13634 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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CDH18Q13634 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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CDH18Q13634 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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CDH18Q13634 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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CDH18Q13634 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CDH18Q13634 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CDH18Q13634 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CDH18Q13634 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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CDH18Q13634 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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