Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL1Q13616 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms