Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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