Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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