Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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