Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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