Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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