Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXA4Q00056 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXA4Q00056 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXA4Q00056 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXA4Q00056 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXA4Q00056 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXA4Q00056 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXA4Q00056 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXA4Q00056 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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HOXA4Q00056 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXA4Q00056 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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