Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ACTBP60709 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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