Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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