Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms