Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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