Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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