Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms