Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.1 ms