Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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DDB1Q16531 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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DDB1Q16531 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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DDB1Q16531 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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DDB1Q16531 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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DDB1Q16531 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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DDB1Q16531 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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DDB1Q16531 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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DDB1Q16531 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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