Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms