Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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