Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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