Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms