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| BRD3 | Q15059 | AF228730.2-201 | ENST00000438784 | 848 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL23AP89-201 | ENST00000439324 | 255 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | FAM26D-205 | ENST00000628083 | 1117 nt | TSL 2 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL391597.2-201 | ENST00000635698 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | MARK2P15-201 | ENST00000432204 | 2186 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF415-201 | ENST00000243643 | 2270 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | CHORDC1-206 | ENST00000529987 | 1698 nt | TSL 3 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR8D1-202 | ENST00000641015 | 8286 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | CNOT10-206 | ENST00000454516 | 2760 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | MS4A14-203 | ENST00000395005 | 2813 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02432-202 | ENST00000509161 | 2839 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | STAU2-207 | ENST00000519961 | 3928 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | CALCRL-203 | ENST00000410068 | 1984 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | UBA6-201 | ENST00000322244 | 9564 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL133383.2-201 | ENST00000622958 | 2336 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | LCA5L-201 | ENST00000288350 | 2416 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | TMCO2-201 | ENST00000372766 | 739 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR135A2-201 | ENST00000384854 | 100 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL049545.1-201 | ENST00000401856 | 572 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SKP267-201 | ENST00000410381 | 285 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | CRYBB2P1-203 | ENST00000415709 | 538 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01198-201 | ENST00000416521 | 500 nt | TSL 3 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC079163.1-201 | ENST00000418416 | 407 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTND4P20-201 | ENST00000424125 | 869 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | BX119904.4-201 | ENST00000424402 | 301 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC091493.1-201 | ENST00000426218 | 411 nt | TSL 3 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL359073.1-201 | ENST00000448036 | 403 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL133217.1-201 | ENST00000450980 | 425 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RPL12P20-201 | ENST00000475538 | 479 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | THAP6-205 | ENST00000504190 | 1004 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01846-201 | ENST00000505908 | 651 nt | TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | CARD16-203 | ENST00000525374 | 503 nt | TSL 3 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | OR4K8P-201 | ENST00000578842 | 1048 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL356515.1-201 | ENST00000611081 | 415 nt | TSL 3 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC243585.1-201 | ENST00000617867 | 607 nt | TSL 3 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC002550.2-201 | ENST00000621246 | 394 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | TEX41-256 | ENST00000626411 | 368 nt | TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | MARCH6-215 | ENST00000640713 | 231 nt | TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC099063.3-201 | ENST00000642066 | 185 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | MGA-201 | ENST00000219905 | 12042 nt | APPRIS P4 TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | FGD4-211 | ENST00000531134 | 2924 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | CFHR3-206 | ENST00000617219 | 1462 nt | TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | TFPI-201 | ENST00000233156 | 3885 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | BIRC3-206 | ENST00000532808 | 4238 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | C6orf10-209 | ENST00000612031 | 2179 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | COPG2-201 | ENST00000330992 | 3073 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | GPR171-201 | ENST00000309180 | 1786 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | PMCH-201 | ENST00000329406 | 766 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR2M2-201 | ENST00000359682 | 1044 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-660P-201 | ENST00000364566 | 109 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | TRAV8-1-201 | ENST00000390430 | 473 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | TRAV26-2-201 | ENST00000390460 | 327 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | PDC-201 | ENST00000391997 | 1242 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL133270.1-201 | ENST00000402635 | 279 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTCO1P17-201 | ENST00000411522 | 491 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL391704.1-203 | ENST00000414903 | 462 nt | TSL 3 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL23AP39-201 | ENST00000415533 | 405 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | SSXP9-201 | ENST00000417503 | 292 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |