Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms