Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms